Эксπир
Регистрация / Вход

Секвенирование ХП хромосомы картофеля с целью идентификации новых генов, определяющих хозяйственно-ценные признаки картофеля

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.512.11.2099
Организация
ВИР
Руководитель работ
Гавриленко Татьяна Андреевна
Продолжительность работ
2007 - 2008, 18 мес.
Бюджетные средства
17,6 млн
Внебюджетные средства
3,61 млн

Работы должны проводиться в рамках критической технологии «Технологии биоинженерии». Работы должны соответствовать по предполагаемому исполнению лучшим мировым стандартам. В результате выполнения каждой работы должен быть создан необходимый потенциал, обеспечивающий переход к проведению опытно-конструкторских работ с целью последующей коммерциализации. Результаты работ должны способствовать дальнейшему инновационному развитию российских технологий в данном приоритетном направлении Программы.

Соисполнители

Предложения

Разработка метода детоксикации организма путём гемосорбции с использованием магнитных сорбентов
Тема
Разработка метода детоксикации организма путём гемосорбции с использованием магнитных сорбентов
Входящий номер
5877
Организация
ИБХФ РАН
Руководитель организации-инициатора
Курочкин Илья Николаевич
Разработка пористого сорбента с антидепрессантными свойствами
Тема
Разработка пористого сорбента с антидепрессантными свойствами
Входящий номер
7054
Организация
НИИКЭЛ
Руководитель организации-инициатора
Летягин Андрей Юрьевич
 Показать еще 6 предложений
 Скрыть другие предложения

Этапы проекта

1
09.04.2007 - 30.06.2007
В ходе выполнения первого этапа календарного плана государственного контракта
проведены следующие работы: (1) анализ научно-технической литературы и нормативно-технической документации, а также анализ других материалов, относящихся к разрабатываемой теме; (2) конструирование библиотек случайных фрагментов для ВАС–клонов геномной ДНК 12-ой хромосомы картофеля; (3) выделение ДНК ВАС-клонов; (4) субклонирование фрагментов геномной ДНК картофеля и секвенирование ДНК. В просеквенированных клонах ВАС-библиотеки идентифицировано несколько гомологов генов устойчивости картофеля к заболеваниям, которые могут быть использованы при последующем проведении ОКР. Проведено сравнение последовательностей структурных генов с базой данных NCBI, в результате чего сделаны предположения об их возможной функции. (5) Создана репрезентативная выборка перспективных для молекулярного скрининга видов дикого и культурного картофеля, а также сортов отечественной и зарубежной селекции из коллекции ГНУ ГНЦ ВИР; начаты работы по выделению тотальной ДНК растений.
Развернуть
2
01.07.2007 - 07.12.2007
В ходе выполнения второго этапа календарного плана государственного контракта проведены следующие работы: (1) Продолжение секвенирования библиотек геномной ДНК XII – ой хромосомы картофеля. В ходе второго этапа работы было прочитано около 9 млн. пар нуклеотидных оснований XII хромосомы генома картофеля.; (2) Аннотация полученной последовательности и поиск потенциальных генов устойчивости к фитопатогенам методами биоинформатики; (3) Оценка коллекции диких и культурных видов, гибридных форм и сортов картофеля на устойчивость к фитопатогенам; выделение ДНК из образцов репрезентативной выборки видов и сортов картофеля. (4) Разработка праймеров на основе данных о последовательностях XII хромосомы. На основе секвенированной последовательности XII хромосомы и уже известных гомологичных клонов видов картофеля разработаны праймеры, амплифицирующие различные группы последовательностей Rx/Gpa2 генов. Подобраны праймерные комбинации, наиболее успешно амплифицирующие фрагменты генов Rx1 картофеля.
Развернуть
3
01.01.2008 - 30.06.2008
В ходе этапа работы проведено создание библиотек и выделение ДНК субклонов .
  Проведена первичная сборка контигов для 24 ВАС-клонов и для субклональных библиотек вставок 8 ВАС-клонов (суммарная длина которых составляет 795032 п.н., что соответствует 2% оценочной длины XII хромосомы картофеля линии RH89-039-16).
  Проведена аннотация собранных ВАС-клонов при помощи программного обеспечения GlimmerHMM.
  Проведен анализ полиморфизма гена Rx 1 (устойчивость к вирусу PVX), картированного на XII хромосоме генома S. tuberosum у 228 образцов 23х диких и культурных видов картофеля из коллекции ВИР
  Были выявлены 5 параллельных вариантов гена Rx 1.
  Кроме того, проведен молекулярный скрининг 96 сортов картофеля с маркерами, тесно сцепленными с геном Rx 1
Развернуть
4
01.07.2008 - 31.10.2008
Впервые получена информация о нуклеотидной последовательности 12 хромосомы картофеля. В аннотированных последовательностях выявлено более 400 генов и около 500 последовательностей 6-ти различных классов повторов.
  Клонированы и секвенированы новые гены устойчивости к Х вирусу (гомологи Rx) и нематоде (гомологи Gpa2) диких видов картофеля. Данная работа имеет уровень, сопоставимый с передовыми научными школами в мире, и соответствует современным тенденциям развития науки в данных областях знаний.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"

Программное мероприятие

1.2 Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований и создание научно-технического задела по технологиям в области наук о жизни
Продолжительность работ
2007 - 2008, 18 мес.
Бюджетные средства
17,6 млн
профинансировано
Продолжительность работ
2007 - 2008, 18 мес.
Бюджетные средства
17,5 млн
Организация
ИБГ РАН
профинансировано
Тема
Работы по проведению 2-ой очереди проблемно-ориентированных поисковых исследований и созданию научно-технического задела в области живых систем по критической технологии «Технологии биоинженерии» (мероприятие 1.2 Программы)
Продолжительность работ
2007 - 2008, 18 мес.
Бюджетные средства
70,4 млн
Количество заявок
31
Тема
Работы по проведению проблемно-ориентированных поисковых исследований и созданию научно-технического задела в области живых систем по критической технологии «Биомедицинские и ветеринарные технологии жизнеобеспечения и защиты человека и животных» (мероприятие 1.2 Программы)
Продолжительность работ
2007 - 2008, 18 мес.
Бюджетные средства
70,4 млн
Количество заявок
21
Тема
Работы по проведению 2-ой очереди проблемно-ориентированных поисковых исследований и созданию научно-технического задела в области живых систем по критической технологии «Биомедицинские и ветеринарные технологии жизнеобеспечения и защиты человека и животных» (мероприятие 1.2 Программы)
Продолжительность работ
2007 - 2008, 18 мес.
Бюджетные средства
70,4 млн
Количество заявок
70
Тема
Работы по проведению 2-ой очереди проблемно-ориентированных поисковых исследований и созданию научно-технического задела в области живых систем по критической технологии «Геномные и посттеномные технологии создания лекарственных средств» (мероприятие 1.2 Программы)
Продолжительность работ
2007 - 2008, 18 мес.
Бюджетные средства
70,4 млн
Количество заявок
27
Тема
Работы по проведению 2-ой очереди проблемно-ориентированных поисковых исследований и созданию научно-технического задела в области живых систем по критической технологии «Клеточные технологии» (мероприятие 1.2 Программы)
Продолжительность работ
2007 - 2008, 18 мес.
Бюджетные средства
70,4 млн
Количество заявок
31