Эксπир
Регистрация / Вход

Совместные российско-французские исследования по созданию медико-биологических приложений технологии биочипов: генотипирование вируса гепатита С, обеспечивающее индивидуальный подбор терапии, и развитие метода параллельного анализа белков в биологических образцах с помощью масс-спектрометрии

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.512.11.2184
Организация
ИМБ РАН
Продолжительность работ
2007 - 2008, 14 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Внебюджетные средства
10,5 млн

Информация отсутствует

Предложения

Создание нового поколения приборов и методов биомедицинской масс-спектрометрии
Тема
Создание нового поколения приборов и методов биомедицинской масс-спектрометрии
Система диагностики злокачественной опухоли, основанная на масс-спектрометрических протеомных профилях крови человека
Тема
Система диагностики злокачественной опухоли, основанная на масс-спектрометрических протеомных профилях крови человека
Входящий номер
6424
Организация
ИБМХ
Руководитель организации-инициатора
Лисица Андрей Валерьевич
 Показать еще 3 предложения
 Скрыть другие предложения

Этапы проекта

1
01.08.2007 - 30.11.2007
1. Проведен анализ научно-технической литературы, нормативно-технической документации и других материалов, относящихся к теме разработки методик генотипирования вируса гепатита С (ВГС), подготовлен перечень результатов интеллектуальной деятельности;
2. Сконструировано множественное выравнивание последовательностей исследуемого региона генома ВГС для всех известных генотипов и подтипов (всего более 2000 последовательностей). На основании созданного выравнивания выбраны пилотные варианты последовательностей праймеров для амплификации фрагмента области NS5B и зонды для идентификации 6 генотипов и 36 подтипов ВГС.
3 Выполнен синтез, очистка и включение флуоресцентной метки праймеров для реакций обратной транскрипции и амплификации. Проведены синтез и очистка набора олигонуклеотидов для иммобилизации на биочипе.
4 Изготовлены пилотные серии биочипов для идентификации генотипов и подтипов ВГС путем нанесения растворов синтезированных олигонуклеотидов на пластиковые подложки микрочипа. Проведена проверка пилотных серий биочипов на предмет равномерности нанесения гелевых элементов, а также оценка концентраций иммобилизованных олигонуклеотидов в ячейках биочипа.
5 Предложено использование электропроводящих подложек с золотым напылением с целью увеличения сигналов и улучшения разрешения пиков в масс-спектрометрическом методе анализа белковых взаимодействия на биочипах. Проведена оценка степени иммобилизации белков в гелевых элементах микрочипа на подложках различных типов.
6 Проведены патентные исследования по ГОСТ 15.011-96.
Развернуть
2
01.12.2007 - 31.12.2007
Произведен отбор и селекция клонов продуцентов генно-инженерных наноантител, распознающих ФРЭС из имеющейся библиотеки одноцепочечных антител.Получена белковая субстанция наноантител, специфически связывающих фактор роста эндотелия сосудов.
Создана in vitro тест-система для высокопроизводительного анализа блокаторов биологической активности фактора роста эндотелия сосудов.
Осуществлен выбор индивидуальных наноантител, способных блокировать биологическую активность ФРЭС. Проведен сравнительный анализ распределения антител к ФРЭС в тканях. Осуществлена обработка экспериментальных данных. Проведена наработка наноантител.
Развернуть
3
01.01.2008 - 31.07.2008
Проведена оптимизация процедур амплификации и гибридизации разработанной методики
  Проведен подбор отечественных ферментов для проведения стадии обратной транскрипции, совмещенной с ПЦР (ОТ-ПЦР.
  Оптимизирован температурно-временной режим стадии ОТ-ПЦР.
  Предложен алгоритм интерпретации флуоресцентной картины гибридизации на биочипе для идентификации генотипа и подтипа ВГС.
  Проведено тестирование иммобилизованных на биочипе специфичных олигонуклеотидов с использованием фрагментов кДНК, полученных при помощи разработанной процедуры ОТ-ПЦР с образцов РНК ВГС в качестве матрицы, предоставленных Лабораторией вирусологии Госпиталя Университета г. Тулуза (Франция).
  Проведено исследование 225 образцов из коллекции РНК ВГС, поддерживаемой в Лаборатории вирусологии с применением разработанного подхода и методики секвенирования фрагмента области NS5B с последующим филогенетическим анализом, используемой в качестве референсной
Развернуть
4
01.08.2008 - 31.10.2008
Проведен сравнительный анализ 345 образцов плазмы крови из Лаборатории вирусологии (г. Тулуза, Франция), содержащий вирус гепатита С с использованием разработанного метода генотипирования, с результатами прямого секвенирования региона NS5B.
  Показано, что разработанный метод способен выявлять клинически значимые, наиболее вирулентные и лекарственно-устойчивые разновидности ВГС с чувствительностью и специфичностью, равной 100%.
  Подготовлены заявки на патент РФ № 2008134981, приоритет от 29.08.2008 г «Тест-система для генотипирования вируса гепатита С»; № 2008138961, приоритет от 01.10.2008 «Реагенты для внутреннего флуоресцентного контроля при определении генотипа и подтипа вируса гепатита С на олигонуклеотидном микрочипе и способ получения таких реагентов».
  Проведен количественный масс-спектральный анализ белков, содержащих масс-метки, в смесях и образцах сыворотки крови.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"

Программное мероприятие

1.2 Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований и создание научно-технического задела по технологиям в области наук о жизни
Проведение поисковых научно-исследовательских работ в целях развития общероссийской мобильности в области синтеза и анализа биотехнических систем медицинского назначения 1. Сравнительный анализ распределения аминокислотных остатков в белковых токсинах болезнетворных водных бактерий. 2. Исследование и разработка методов параллельной обработки и анализа биомедицинских сигналов для оценки функционального состояния организма. 3. Статистические методы оценки сердечно-сосудистого риска. 4. Обоснование метрологических медико-технических требований для лазерной доплеровской флоуметрии. 5. Исследование информационного обеспечения обработки акустических сигналов биосистем. 6. Синхронный анализ фотоплетизмограмм и электрокардиограмм на коротких выборках данных. 7. Идентификация распределения гидрофобных областей и пространственного заряда в первичной структуре полипептидов методами фрактального анализа. 8. Разработка и исследование методов классификации и формирования описаний медико-биологических объектов с помощью
Продолжительность работ
2011, 6 мес.
Бюджетные средства
2,2 млн
Организация
CПбГЭТУ "ЛЭТИ"
профинансировано
Продолжительность работ
2015 - 2017, 26 мес.
Бюджетные средства
13,2 млн
Организация
ИМБ РАН
профинансировано
Тема
Разработка технологии масс-спектрометрического экспресс-анализа жидких биологических проб и выпуск опытных образцов лазерного масс-спектрометра.
Продолжительность работ
2009 - 2011, 25 мес.
Бюджетные средства
115 млн
Количество заявок
1
Тема
Выполнение комплекса работ по материально-техническому обеспечению подготовки и проведения Российско-Французского форума ректоров ведущих ВУЗов России и Франции «Русский день: образование, наука, бизнес», на основании мониторинга результатов участия российских вузов и научно-исследовательских организаций в мероприятиях Года сезонов русского языка и литературы во Франции и французского языка и литературы в России.
Продолжительность работ
2012, 1 мес.
Бюджетные средства
2 млн
Количество заявок
1
Тема
Выполнение комплекса работ по информационно-презентационному обеспечению подготовки и проведения Российско-Французского форума ректоров ведущих ВУЗов России и Франции «Русский день: образование, наука, бизнес», на основании мониторинга результатов участия российских вузов и научно-исследовательских организаций в мероприятиях Года сезонов русского языка и литературы во Франции и французского языка и литературы в России.
Продолжительность работ
2012, 2 мес.
Бюджетные средства
2 млн
Количество заявок
1
Тема
Исследование инновационного потенциала в области высоких технологий с целью создания международного российско-французского центра трансфера технологий
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
2,5 млн
Количество заявок
4
Тема
Доклинические исследования лекарственного средства для терапии вирусного гепатита С на основе интерференции РНК
Продолжительность работ
2015 - 2017, 29 мес.
Бюджетные средства
33 млн
Количество заявок
1