Эксπир
Регистрация / Вход

Поиск селективных ингибиторов поли(ADP-рибоза)-полимеразы I человека и определение их биологических и фармакологических свойств

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
02.512.11.2247
Организация
ИХБФМ СО РАН
Руководитель работ
Лаврик Ольга Ивановна
Продолжительность работ
2008 - 2009, 16 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Внебюджетные средства
0 млн

Поиск селективных ингибиторов поли(ADP-рибоза)-полимеразы I человека на основе компьютерного анализа (докинга) синтетических и природных соединений и экспериментальных систем для анализа активности фермента in vitro.

Соисполнители

Организация
НИИ ФХБ МГУ
Организация
ИМБ РАН
Организация
ИМГ РАН

Участники проекта

Зам. руководителя работ
Ходырева Светлана Николаевна

Этапы проекта

1
07.07.2008 - 30.09.2008
Проведен анализ научно-технической литературы.
  Разработана лабораторная методика синтеза соединений - потенциальных ингибиторов ПАРП-1 человека.
  Предложен удобный метод синтеза структурного элемента поли(ADP-рибозы) 2`-О-?-D-рибофуранозиладенозина.
  Разработана тест-система определения ингибиторных характеристик соединений.
  Проведено выделение рекомбинантной ПАРП-1 человека и с ее использованием проведена оценка ингибиторных свойств нескольких дисахаридных нуклеозидов .
  На основе литературных данных произведен отбор пяти культур трансформированных и нормальных клеток человека, пригодных для оценки эффективности противоопухолевого действия ингибиторов ПАРП-
  Проведены патентные исследования в соответствии с п.5.2. ТЗ.
Развернуть
2
01.10.2008 - 05.12.2008
Проведена наработка препаративных количеств ПАРП-1 и р24 – ее ДНК-связывающего фрагмента, а также ключевых белков ЭРО – АРЕ1 и ДНК-полимеразы бета.
  Разработана схема выделения регуляторного белка ЭРО – HMGB1 и проведена препаративная наработка этого белка из тимуса теленка.
Методом молекулярного докинга проведена валидация адекватности полноатомной модели ПАРП-1, созданной на первом этапе выполнения НИР
  Проведен синтез 2`-О-альфа-D-рибофуранозилуридина, проведена характеризация полученного продукта методами ЯМР, УФ- и Масс -спектроскопии. Чистота препарата соответствует требованиям ТЗ.
  Выбраны и апробированы методы оценки цитотоксичности исследуемых соединений, показана их пригодность и оценена чувствительность.
Развернуть
3
01.01.2009 - 30.06.2009
Проведена коррекция модели центра связывания с помощью опции ковалентного докинга программы Lead Finder и осуществлена дополнительная оптимизация структуры методом неограниченной молекулярной динамики в явно заданной водной среде.
Развернуть
4
01.07.2009 - 30.11.2009
Осуществлен синтез соединений, потенциальных ингибиторов ПАРП-1, выбранных на основе данных моделирования. Исследовано влияние пяти новых ингибиторов ПАРП-1 человека на чувствительность опухолевых клеток человека к действию доксорубицина. Проведен скрининг клеточных линий на содержание ПАРП-1 белка с использованием химически активной ДНК фага М13. Отобраны линии, содержащие максимальное количество ПАРП-1, для последующего ингибирования эндогенной ПАРП-1 экстрактов новыми ингибиторами. Определено влияние ингибиторов ПАРП-1 на эффективность автомодификации эндогенной ПАРП-1 в клеточных экстрактах с использованием химически активной ДНК фага М13.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"

Программное мероприятие

1.2 Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований и создание научно-технического задела по технологиям в области наук о жизни
Продолжительность работ
2011 - 2012, 15 мес.
Бюджетные средства
5,5 млн
Организация
ИМБ РАН
профинансировано
Продолжительность работ
2012 - 2013, 14 мес.
Бюджетные средства
1,47 млн
профинансировано
Тема
Поиск селективных ингибиторов поли(ADP-рибоза)-полимеразы I человека и определение их биологических и фармакологических свойств.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2
Тема
Изучение новых морских природных соединений, выделение, структура, биосинтез и биологическая активность. Изучение ферментов из морских макро- и микроорганизмов. Изучение молекулярных основ иммунных процессов, в том числе антибактериального и антиопухолевого иммунитета.Изучение биологической активности и механизма действия природных и синтетических соединений. на установке: "Научно - исследовательское судно "Академик Опарин". (рег. № 2-1.7)"
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
2,5 млн
Количество заявок
1
Тема
Доклинические исследования лекарственного средства на основе ингибитора вирусной РНК-полимеразы для лечения хронического гепатита С.
Продолжительность работ
2016 - 2018, 20 мес.
Бюджетные средства
33 млн
Количество заявок
2
Тема
Доклинические исследования гемостатического лекарственного средства на основе синтетического трипептидного фрагмента ингибитора плазмина.
Продолжительность работ
2012 - 2014, 30 мес.
Бюджетные средства
33 млн
Количество заявок
1
Тема
Направленный поиск противовирусных соединений избирательного действия на основе модифицированных гетероциклических оснований нуклеиновых кислот и нуклеозидов.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2