Эксπир
Регистрация / Вход

Разработка метода компьютерного моделирования структур макромолекул на основе рентгеноструктурных данных.

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
3 млн
Внебюджетные средства
0 млн

Разработка метода компьютерного моделирования структур макромолекул на основе полноматричного метода наименьших квадратов, основанного на оригинальном алгоритме. Метод будет реализоан в виде программного продукта, обеспечивающего все преимущества использования полноматричной схемы уточнения структур макромолекул.

Этапы проекта

1
19.08.2008 - 30.11.2008
В ходе выполнения работ по проекту № 02.513.11.3388 был разработан алгоритм неявного умножения матрицы на вектор с использованием быстрого Фурье-преобразования. На базе этого алгоритма создана версия программы FMLSQ для уточнения по методу наименьших квадратов. Программа содержит около 100 000 линий кода на языках программирования ФОРТРАН 95 и С. Программа отлаживалась и тестировалась как на небольших искусственных трехатомных структурах, так и на реальных структурах макромолекул размер которых достигал 132 000 атомов.
В процессе разработки показана принципиальная возможность использования программы для расчетов ошибок (стандартных отклонений) параметров модели для структур практически любого размера.
Создана первая версия инструкции для потенциальных пользователей предварительной версии программы.
Рассчитаны необходимые производные для введения в расчеты стереохимических ограничений необходимые для создания окончательной версии программы.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"

Программное мероприятие

1.3 Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований и создание научно-технического задела в области индустрии наносистем
Тема
Разработка метода компьютерного моделирования структур макромолекул на основе рентгеноструктурных данных.
Продолжительность работ
2008, 3 мес.
Бюджетные средства
3 млн
Количество заявок
2
Тема
Создание программных средств и расчетных методов компьютерного моделирования физико-механических процессов и наноструктурирования в сталях с нестационарной структурой при термонагружении.
Продолжительность работ
2009 - 2010, 12 мес.
Бюджетные средства
15 млн
Количество заявок
2
Тема
Исследование и разработка технологии суперкомпьютерного молекулярного моделирования на базе реконфигурируемых вычислительных систем.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 16 мес.
Бюджетные средства
12 млн
Количество заявок
2
Тема
Разработка интерактивной Веб-ориентированной системы для решения задач молекулярного моделирования с использованием технологий распределенных вычислений.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Количество заявок
2
Тема
Создание программно-вычислительного комплекса для компьютерного моделирования наноструктурных сорбентов и процессов адсорбции
Продолжительность работ
2014 - 2016, 26 мес.
Бюджетные средства
48,6 млн
Количество заявок
8