Эксπир
Регистрация / Вход

Разработка ускоренной системы идентификации возбудителей внутрибольничных инфекций с одновременным определением их лекарственной устойчивости на основе ДНК-чипов

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
14.607.21.0064
Досье недоступно
Продолжительность работ
2014 - 2016, 27 мес.
Бюджетные средства
83,55 млн
Внебюджетные средства
21,63 млн

"Разработка тест-систем на основе ДНК-чипов для идентификации возбудителей инфекционных заболеваний с одновременным определением генетических детерминант резистентности к спектру антимикробных препаратов (на примере внутрибольничных
инфекций, инфекций, приводящих к нарушению репродуктивных функций или др., имеющих социальную значимость)"

Этапы проекта

1
23.09.2014 - 31.12.2014
Проведен анализ публикаций, описывающих уникальные генетические маркеры идентификации и детерминанты, отвечающие за возникновение антибиотикорезистентности. Определен круг генетических последовательностей потенциальных мишеней для выявления указанных детерминант. Намечены пути эффективной амплификации выбранных мишеней для получения преимущественно одноцепочечной флуоресцентно-меченной ДНК, пригодной для гибридизации на микрочипе. Отобрано 12 изолятов возбудителей ВБИ (5 – P. aeruginosa, 3 – A. baumannii, 2 – K. pneumoniae).
Развернуть
2
01.01.2015 - 30.06.2015
Создание коллекций образцов ДНК бактериальных патогенов (часть I).
  Сбор клинических образцов и получение чистых культур возбудителей ВБИ и внебольничных (контрольных) штаммов микроорганизмов (часть II).
  Идентификация микроорганизмов и определение их резистентности к антибиотикам с помощью фенотипических и протеомных методов (часть II).
  Разработка комплекта реагентов для амплификации (АМ), обеспечивающего амплификацию и флуоресцентное маркирование целевых фрагментов генома с целью идентификации возбудителей ВБИ и молекулярных детерминант устойчивости к антибактериальным препаратам.
  Иммобилизация олигонуклеотидов из числа молекулярных зондов СР на подложках, изготовление экспериментальных серий ДНК-чипов.
  Проведение испытаний СР в соответствии с Программой и методиками испытаний.
  Проведение работ по достижению показателей результативности проекта
Развернуть
3
01.07.2015 - 31.12.2015
Создана коллекция образцов бактериальных ДНК (411 образцов). Проведен сбор клинических образцов и получение чистых культур возбудителей возбудителей больничных инфекций и внебольничных (контрольных) штаммов. Проведена идентификация микроорганизмов и определение их резистентности к антибиотикам. Разработаны комплекты реагентов для амплификации. Изготовлены экспериментальные серии ДНК-чипов. Проведены испытания СР в соответствии с программой и методиками испытаний. Разработан и изготовлен контрольный образец комплекта для гибридизации, обеспечивающего гибридизацию флуоресцентно меченых фрагментов, полученных с использованием комплекта АМ, на биочипах с иммобилизованными молекулярными зондами. Проведена модификация программного обеспечения «ImaGeWare». Создана коллекция микроорганизмов, полученных из биологического материала (524 изолята возбудителей ВБИ), для контроля аналитических характеристик макета тест-системы. Синтезированы праймеры для характеристик коллекции образцов ДНК.
Развернуть
4
01.01.2016 - 30.06.2016
Проведена оптимизация процедур мультиплексной амплификации на биочипах с иммобилизованными олигонуклеотидами с использованием образцов ДНК из созданной коллекции. Осуществлена корректировка эскизной конструкторской документации на макет тест-системы. Разработана программа и методики лабораторных испытаний макета Тест-системы. Разработан лабораторный регламент изготовления Тест-системы. Изготовлены макеты Тест-системы для проведения испытаний. Проведены испытания макетов тест-системы в соответствии с Программой и методиками лабораторных испытаний макета Тест-системы.
Развернуть
5
01.07.2016 - 31.12.2016
Разработан проект Инструкции по применению, содержащий информацию о порядке практического использования Тест-системы. Определены требования к подготовке клинических образцов для анализа. Разработана Программа и методики клинико-лабораторных испытаний макета Тест-системы. Проведены испытания макетов тест-системы, подтвердившие полное соответствие характеристик тест-системы всем требованиям, заданным ТЗ. Подготовлен проект технического задания на ОКР. Подготовлены рекомендации по возможности использования результатов ПНИ в реальном секторе экономики. Разработаны методические рекомендации по использованию тест-системы в клинико-диагностических лабораториях. Проведены работы по достижению показателей результативности проекта.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы"

Программное мероприятие

1.3 Проведение прикладных научных исследований и разработок, направленных на создание продукции и технологий
Тема
Комплексные тест-системы для идентификации и анализа лекарственной устойчивости возбудителей инфекций.
Продолжительность работ
2014 - 2016, 27 мес.
Бюджетные средства
173 млн
Количество заявок
4
Тема
Доклинические исследования лекарственного средства для профилактики и терапии гнойно-септических внутрибольничных инфекций, вызываемых условно патогенными бактериями.
Продолжительность работ
2011 - 2013, 27 мес.
Бюджетные средства
33 млн
Количество заявок
1
Тема
Создание метода дифференциальной диагностики и генетического анализа наследственных заболеваний, вызывающих поражение печени у новорожденных детей, на основе молекулярного многопараметрического анализа.
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
7,8 млн
Количество заявок
2
Тема
Разработка метода экспресс-диагностики перинатальных инфекций на основе количественной оценки содержания ДНК цитомегаловируса и бактерий, колонизирующих организм плода и новорожденного.
Продолжительность работ
2009 - 2010, 17 мес.
Бюджетные средства
7 млн
Количество заявок
4
Тема
Системы иммунодетекции особо опасных инфекций, в том числе с использованием технологии фагового дисплея.
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Количество заявок
3