Эксπир
Регистрация / Вход

Исследования методами структурной биологии (рентгеноструктурного анализа и молекулярного моделирования) ферментов метаболизма нуклеиновых кислот важных в терапии онкологических, инфекционных заболеваний и промышленной биотехнологии

Стадии проекта
Предложение принято
Конкурс завершен
Проект закончен
Проект
16.512.11.2235
Досье недоступно
Продолжительность работ
2011 - 2012, 15 мес.
Бюджетные средства
6,6 млн
Внебюджетные средства
1,17 млн

Определить пространственные структуры и функциональные характеристики ферментов, перспективных для [биотехнологии, создания терапевтических препаратов].

Участники проекта

Зам. руководителя работ
Носик Валерий Леонидович

Этапы проекта

1
12.07.2011 - 30.09.2011
Выбраны химические субстанции (потенциальных лекарственных препаратов и биотехнологических агентов) для ферментов-мишеней: уридинфосфорилаз, рибосом инактивирующих белков типа 2 и эндонуклеаз. Проведен выбор оптимальных экспериментальных и теоретических методов исследования структурно-функциональной взаимосвязи биомакромолекулярных комплексов.
Развернуть
2
01.10.2011 - 20.12.2011
Разработан протокол моделирования межатомных взаимодействий (молекулярный докинг) и молекулярной динамики в комплексах уридинфосфорилаз из S.typhimurium и Homo Sapiens c одним из лекарственных препаратов (в качестве лиганда) широко испольуемым в мировой практике. Выполнен фармакофорный поиск пространственной структуры лигандов (потенциальных лекарственных препаратов и биотехнологических агентов) к уридинфосфорилазам, рибосом инактивирующим белкам типа 2, эндонуклеазе. Выбраны оптимальные лиганды к уридинфосфорилазам, рибосом инактивирующим белкам типа 2, эндонуклеазе.
Развернуть
3
01.01.2012 - 30.06.2012
Наработана экспериментальная партия гомогенного препарата белка Проведён скрининг условий кристаллизации комплексов уридинфосфорилаз, рибосом инактивирующих белков типа 2 с рентгенодифракционным контролем качества кристаллов. Модифицирована методика выделения, очистки и условий кристаллизации биомакромолекулярных комплексов уридинфосфорилаз. Выращены кристаллы комплексов уридинфосфорилаз, рибосом инактивирующих белков 2-го типа с лигандами. Получены рентгенодифракционные наборы экспериментальных интенсивностей с использованием источников синхротронного излучения DESY (Гамбург, Германия) и BESSY (Берлин, Германия). Обработаны экспериментальные рентгенодифракционные наборы интенсивностей, полученных на синхротронных станциях, решены и уточнены структуры комплексов уридинфосфорилаз, рибосом инактивирующих белков типа 2 эндонуклеазы с атомным разрешением и высокой точностью.Проведён вычислительный эксперимент над комплексами уридинфосфорилаз, рибосом инактивирующих белков 2-го типа и эндонуклеаз.
Развернуть
4
01.07.2012 - 31.10.2012
Выполнено рациональное компьютерное конструирование лигандов (субстратов и ингибиторов) и мутантных форм исследуемых ферментов (уридинфосфорилаз, рибосом инактивирующих белков типа 2, эндонуклеаз) – потенциальных фармацевтических препаратов и биотехнологических агентов. Разработаны рекомендации по использованию результатов проведенных НИР в реальном секторе экономики, а также в дальнейших исследованиях и разработках, разработан проект технического задания для проведения прикладной НИР.
Развернуть

Программа

Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"

Программное мероприятие

1.2 Проведение проблемно-ориентированных поисковых исследований и создание научно-технического задела по технологиям в области наук о жизни
Продолжительность работ
2010 - 2012, 31 мес.
Бюджетные средства
9 млн
профинансировано
Продолжительность работ
2011 - 2012, 15 мес.
Бюджетные средства
6 млн
профинансировано
Проведение поисковых научно-исследовательских работ в области естественных наук: 1. Конъюгация полупроводниковых наночастиц с противораковыми антителами, их физико-химическая характеристика и изучение взаимодействия с клетками; 2. Разработка новых препаратов на основе соединений платины для терапии онкологических заболеваний; 3. Молекулярно-генетическое и морфологическое изучение азотфиксирующих микроорганизмов ризосферы озимой ржи; 4. Исследование механизмов старения и коррозионного растрескивания под напряжением сталей труб магистральных нефте- и газопроводов; 5. Особенности диссипативного туннелирования в структурах с квантовыми точками; 6. Исследование электронной структуры самоформирующихся гетеронаноструктур In(Ga)As/GaAs методами сканирующей зондовой микроскопии; 7. Исследование спектрально-люминесцентных свойств лазерных кристаллов, активированных редкоземельными ионами; 8. Теория и практика рентгеноструктурного анализа соединений урана; 9. Разработка методов синтеза и исследование свойств макрогетероциклических производных карборанов; 10. Лабораторное моделирование волновых явлений в ионосферно-магнитосферной плазме
профинансировано
Тема
Рентгеноструктурные исследования ферментов, представляющих интерес для биомедицины и промышленной биотехнологии.
Продолжительность работ
2011 - 2012, 15 мес.
Бюджетные средства
32 млн
Количество заявок
7
Тема
Выделение, функциональная характеристика и определение пространственной структуры новых промышленно значимых термостабильных ферментов
Продолжительность работ
2008 - 2009, 17 мес.
Бюджетные средства
20 млн
Количество заявок
1
Тема
Создание ферментов для использования в промышленной биотехнологии.
Продолжительность работ
2011 - 2012, 20 мес.
Бюджетные средства
60 млн
Количество заявок
11
Тема
Ферменты для молекулярной биологии и генетической инженерии
Продолжительность работ
2005 - 2006, 23 мес.
Бюджетные средства
10 млн
Количество заявок
5
Тема
Рациональный дизайн промышленных ферментов, основанный на методах молекулярного моделирования
Продолжительность работ
2008 - 2011, 39 мес.
Бюджетные средства
72 млн
Количество заявок
2